茶树液相芯片助力茶树分子育种

        中国农业科学院茶叶研究所茶树种质资源创新团队牵头研制了首张茶树TEA5K液相芯片，并利用其完成了茶树品种鉴定、茶树遗传图谱构建、茶树关键农艺性状的QTL定位，以及茶树遗传进化分析等研究工作。相关研究成果发表于《Journal of Nanobiotechnology》。　　研究基于靶向测序基因分型（Genotyping by Target Sequencing, GBTS）技术，首先对我国200多个主要茶树育成品种进行了基因型检测，结果显示同一品种内的遗传相似度在 92.53% 以上，而不同品种间的遗传相似度均低于 82.36%，这为设定阈值实现茶树品种的准确鉴别留下了充足空间。随后课题组利用该芯片，构建了一张包含3274个SNP标记，总图距长2225.19cM的遗传图谱，并利用该图谱定位了茶树氨基酸组分相关的多个QTL位点，以及与‘黄金芽’品种白化叶色变异相关联的两个紧密连锁的分子标记。最后，课题组利用该芯片对519份茶树种质资源的群体结构和系统发育关系进行了分析，结果表明，现代栽培品种的遗传多样性低于地方资源，此外野生资源与现代栽培品种之间也存在显著的遗传分化，这为我们今后充分利用野生茶树改良现代品种提供了理论依据。