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上海交大合作开发基于三代测序数据构建水稻泛基因组新方法

发布日期:2022/7/5 9:46:58 点击数:828

        上海交通大学生命科学技术学院韦朝春团队和中国农业科学院作物科学研究所合作完成基于三代测序数据的水稻泛基因组构建及分析,相关成果在基因组学顶级期刊《Genome Research》在线发表。该研究通过引入一系列新方法处理长读长测序,构建了针对三代测序(TGS)数据的水稻泛基因组构建方法。与水稻参考基因组日本晴相比,新方法从105 个栽培稻(OS)构建的泛基因组包含 604 Mb 的新序列,比此前由~3000 个栽培稻品种二代测序数据(SGS)构建的泛基因组(~270Mb新序列)更全面。

 
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