华中农业大学生物信息团队发布油菜群体变异数据库

        华中农业大学生物信息团队杨庆勇教授课题组在国际学术期刊《Molecular Plant》在线发表题为“BnVIR: bridging the genotype-phenotype gap to accelerate mining of candidate variations for traits in Brassica napus”的研究论文，该研究建立了甘蓝型油菜基因型与基因表达、表型的关联，为快速、高效地挖掘油菜候选变异/基因提供了平台。该研究首先构建了一套由2,311个甘蓝型油菜核心种质鉴定的10,090,561个遗传变异的数据集，其中包括SNP、InDel和不同种类的SV，这是目前已发表的最为系统、最为完整的甘蓝型油菜遗传变异集合。该研究以其中1,703个材料的18个性状的表型数据和309个材料的RNA-seq数据为基础，构建出甘蓝型油菜变异信息资源数据库BnVIR（http://yanglab.hzau.edu.cn/BnVIR）。